日本的都、道、府、縣是平行的一級行政區，直屬中央政府，但各都、道、府、縣都擁有自治權。全國分為1都（東京都：Tokyo）、1道（北海道：Hokkaido），2府（大阪府：Osaka、京都府：Kyoto）和43個縣（省），下設市、町、村。其辦事機構稱為“廳”，即“都廳”、“道廳”、“府廳”、“縣廳”，行政長官稱為“知事”。每個都、道、府、縣下設若干個市、町（相當于中國的鎮）、村。其辦事機構稱“役所”，即“市役所”、“町役所”、“村役所”，行政長官稱為“市長”、“町長”、“村長”。

北海道地方：北海道（ほっかいどう）

東北地方（とうほくちほう）：青森（あおもり）巖手（いわて）宮城（みやぎ）秋田（あきた）山形（やまがた）福島（ふくしま）

關東地方（かんとうちほう）：茨城（いばらき）栃木（とちぎ）群馬（ぐんま）埼玉（さいたま）千葉（ちば）神奈川（かながわ）東京都（とうきょうと）

中部地方（ちゅうぶちほう）：新瀉（にいがた）富山（とやま）石川（いしかわ）福井（ふくい）山梨（やまなし）長野（ながの）岐阜（ぎふ）靜岡（しずおか）愛知（あいち）

近畿地方（きんきちほう）：三重（みえ）滋賀（しが）京都府（きょうとふ）大阪府（おおさかふ）兵庫（ひょうご）奈良（なら）和歌山（わかやま）

中國四國地方（ちゅうごくしこくちほう）：鳥取（とっとり）島根（しまね）岡山（おかやま）廣島（ひろしま）山口（やまぐち）徳島（とくしま）香川（かがわ）愛媛（えひめ）高知（こうち）

九州地方（きゅうしゅうちほう）：福岡（ふくおか）佐賀（さが）長崎（ながさき）熊本（くまもと）大分（おおいた）宮崎（みやざき）鹿兒島（かごしま）沖繩（おきなわ）

2012年1月23日，日本政府正式決定成立復興廳，以應對東日本大地震。復興廳的設置期限為震后10年，即2021年3月底。總部設于東京，并在盛岡、仙臺和福島3市設置統籌支部的“復興局”。